La región del Parque Nacional Chagres ha tenido gran importancia a lo largo del tiempo. En la época precolombina, pueblos indígenas como los Ñürüm y Emberá habitaron la zona utilizando prácticas sostenibles. Durante la colonia, el río Chagres fue una ruta clave entre el Caribe y el Pacífico, protegido por fortificaciones como San Lorenzo. Con la llegada del ferrocarril en el siglo XIX, cambió el transporte, aunque el río siguió siendo utilizado. En el siglo XX, la construcción del Canal de Panamá transformó la cuenca para garantizar el suministro de agua. Finalmente, en 1985 se declaró el parque nacional para proteger sus recursos naturales, consolidando su rol ecológico y cultural a través de programas de conservación y ecoturismo.

El parque protege bosques tropicales húmedos de montaña y premontañosos, con especies emblemáticas como las ceibas (Ceiba pentandra), la caoba (Swietenia macrophylla) y numerosos helechos arborescentes. En las zonas ribereñas se encuentran manglares y vegetación de ribera.

Entre la fauna destacan el mono aullador (Alouatta palliata), el perezoso de dos dedos (Choloepus hoffmanni), el oso hormiguero (Tamandua mexicana) y una gran diversidad de aves, incluidos el trogón esmeralda (Trogon comptus) y el águila arpía (Harpia harpyja). Reptiles como la boa constrictor y anfibios endémicos completan el ecosistema.